パッケージ

uPD780021Aで、 湿度インジケータの 20%が "WARNING(警告)"、40%が "EXAMINE(調査)" とありますが、 どちらのほうが危険度が高いのでしょうか？

これはあくまで湿度の目安を示しており、40%がピンクになった場合には必ずプリベークが必要になります。 20%でもその時間が長く続くと吸湿はすすみますので、 保管期間が長くなった場合にはプリベークを行うことをお奨めします。
なお、このインジケータはパックされたままの状態での湿度を確認するためのものです。
開封した後は表示が無効となります。

uPD784031GK-BE9 パッケージ：80-P-TQFP(fine pitch)(12×12) とありますが、 2001年5月頃にはパッケージが変わるそうですが、何が変わるのでしょうか？

BE9が 9EUとなり、パッケージの厚さが若干薄くなり、リードの曲げ方(角度)が少し変わります。

uPD789316GK-XXX-9ETのパッケージに関して下記の3つのどれに当てはまるのでしょうか？
　(1) JEITA (EIAJ) type
　(2) JEDEC type
　(3) その他

(2) JEDEC type　です。